Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR5P32302 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms