Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR1P32246 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR1P32246 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR1P32246 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR1P32246 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR1P32246 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR1P32246 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR1P32246 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR1P32246 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR1P32246 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR1P32246 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR1P32246 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR1P32246 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR1P32246 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR1P32246 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR1P32246 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR1P32246 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR1P32246 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR1P32246 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR1P32246 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR1P32246 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR1P32246 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR1P32246 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CCR1P32246 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR1P32246 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR1P32246 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR1P32246 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR1P32246 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR1P32246 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR1P32246 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR1P32246 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR1P32246 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR1P32246 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR1P32246 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR1P32246 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR1P32246 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR1P32246 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR1P32246 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR1P32246 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR1P32246 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR1P32246 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR1P32246 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR1P32246 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR1P32246 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR1P32246 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR1P32246 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR1P32246 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR1P32246 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR1P32246 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR1P32246 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR1P32246 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR1P32246 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR1P32246 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR1P32246 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms