Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASQ1P31415 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASQ1P31415 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASQ1P31415 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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