Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPS1P31327 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CPS1P31327 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CPS1P31327 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CPS1P31327 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CPS1P31327 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CPS1P31327 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CPS1P31327 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CPS1P31327 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CPS1P31327 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CPS1P31327 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CPS1P31327 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPS1P31327 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPS1P31327 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPS1P31327 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPS1P31327 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPS1P31327 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPS1P31327 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPS1P31327 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPS1P31327 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CPS1P31327 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CPS1P31327 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CPS1P31327 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CPS1P31327 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CPS1P31327 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CPS1P31327 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CPS1P31327 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CPS1P31327 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CPS1P31327 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CPS1P31327 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CPS1P31327 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CPS1P31327 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CPS1P31327 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CPS1P31327 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CPS1P31327 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CPS1P31327 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CPS1P31327 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CPS1P31327 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CPS1P31327 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CPS1P31327 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CPS1P31327 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CPS1P31327 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CPS1P31327 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CPS1P31327 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CPS1P31327 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CPS1P31327 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CPS1P31327 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CPS1P31327 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CPS1P31327 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CPS1P31327 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CPS1P31327 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CPS1P31327 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CPS1P31327 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CPS1P31327 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CPS1P31327 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CPS1P31327 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CPS1P31327 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CPS1P31327 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CPS1P31327 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CPS1P31327 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CPS1P31327 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CPS1P31327 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPS1P31327 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CPS1P31327 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CPS1P31327 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CPS1P31327 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CPS1P31327 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CPS1P31327 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CPS1P31327 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CPS1P31327 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CPS1P31327 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CPS1P31327 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CPS1P31327 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CPS1P31327 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms