Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD11P31277 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD11P31277 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms