Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFRSF8P28908 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFRSF8P28908 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms