Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD38P28907 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD38P28907 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD38P28907 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD38P28907 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD38P28907 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD38P28907 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD38P28907 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD38P28907 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD38P28907 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD38P28907 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD38P28907 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD38P28907 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD38P28907 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD38P28907 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD38P28907 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD38P28907 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD38P28907 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD38P28907 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD38P28907 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD38P28907 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD38P28907 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD38P28907 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD38P28907 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD38P28907 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD38P28907 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD38P28907 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD38P28907 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD38P28907 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD38P28907 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD38P28907 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD38P28907 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD38P28907 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD38P28907 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD38P28907 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD38P28907 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD38P28907 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD38P28907 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD38P28907 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD38P28907 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD38P28907 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD38P28907 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD38P28907 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD38P28907 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD38P28907 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD38P28907 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD38P28907 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD38P28907 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD38P28907 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD38P28907 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD38P28907 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD38P28907 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD38P28907 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD38P28907 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD38P28907 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD38P28907 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD38P28907 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD38P28907 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD38P28907 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD38P28907 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD38P28907 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD38P28907 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD38P28907 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD38P28907 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD38P28907 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms