Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE4AP27815 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms