Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARK3P27448 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARK3P27448 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARK3P27448 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MARK3P27448 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARK3P27448 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARK3P27448 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARK3P27448 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARK3P27448 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARK3P27448 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARK3P27448 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARK3P27448 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARK3P27448 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARK3P27448 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARK3P27448 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARK3P27448 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARK3P27448 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MARK3P27448 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARK3P27448 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARK3P27448 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARK3P27448 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARK3P27448 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARK3P27448 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARK3P27448 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARK3P27448 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARK3P27448 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARK3P27448 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARK3P27448 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARK3P27448 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARK3P27448 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARK3P27448 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARK3P27448 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARK3P27448 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARK3P27448 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARK3P27448 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MARK3P27448 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARK3P27448 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARK3P27448 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARK3P27448 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARK3P27448 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARK3P27448 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARK3P27448 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARK3P27448 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARK3P27448 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARK3P27448 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARK3P27448 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARK3P27448 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARK3P27448 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MARK3P27448 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARK3P27448 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARK3P27448 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARK3P27448 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MARK3P27448 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARK3P27448 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARK3P27448 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARK3P27448 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARK3P27448 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARK3P27448 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARK3P27448 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARK3P27448 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MARK3P27448 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARK3P27448 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARK3P27448 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARK3P27448 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARK3P27448 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MARK3P27448 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARK3P27448 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARK3P27448 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARK3P27448 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARK3P27448 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARK3P27448 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARK3P27448 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARK3P27448 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARK3P27448 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MARK3P27448 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARK3P27448 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARK3P27448 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARK3P27448 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARK3P27448 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARK3P27448 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARK3P27448 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARK3P27448 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARK3P27448 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARK3P27448 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARK3P27448 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARK3P27448 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARK3P27448 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARK3P27448 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARK3P27448 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARK3P27448 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARK3P27448 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARK3P27448 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARK3P27448 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARK3P27448 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARK3P27448 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARK3P27448 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARK3P27448 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms