Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HMGB2P26583 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMGB2P26583 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMGB2P26583 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HMGB2P26583 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms