Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNA2P26232 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNNA2P26232 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA2P26232 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA2P26232 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA2P26232 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA2P26232 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA2P26232 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA2P26232 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA2P26232 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA2P26232 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA2P26232 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNNA2P26232 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms