Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRBP23467 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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