Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME2P23368 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ME2P23368 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME2P23368 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME2P23368 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME2P23368 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME2P23368 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME2P23368 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME2P23368 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME2P23368 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME2P23368 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME2P23368 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME2P23368 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME2P23368 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME2P23368 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME2P23368 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ME2P23368 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME2P23368 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ME2P23368 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME2P23368 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ME2P23368 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME2P23368 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME2P23368 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME2P23368 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME2P23368 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME2P23368 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME2P23368 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME2P23368 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ME2P23368 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME2P23368 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME2P23368 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME2P23368 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME2P23368 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME2P23368 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME2P23368 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME2P23368 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ME2P23368 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME2P23368 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME2P23368 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME2P23368 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME2P23368 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME2P23368 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME2P23368 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME2P23368 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME2P23368 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ME2P23368 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME2P23368 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ME2P23368 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME2P23368 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME2P23368 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME2P23368 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ME2P23368 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME2P23368 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME2P23368 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME2P23368 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ME2P23368 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME2P23368 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME2P23368 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME2P23368 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME2P23368 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME2P23368 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME2P23368 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME2P23368 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ME2P23368 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ME2P23368 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME2P23368 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME2P23368 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME2P23368 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME2P23368 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ME2P23368 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME2P23368 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME2P23368 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME2P23368 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME2P23368 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ME2P23368 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME2P23368 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ME2P23368 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME2P23368 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME2P23368 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ME2P23368 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME2P23368 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME2P23368 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME2P23368 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms