Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FGFR4P22455 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGFR4P22455 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms