Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BGNP21810 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BGNP21810 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BGNP21810 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BGNP21810 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BGNP21810 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BGNP21810 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BGNP21810 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BGNP21810 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BGNP21810 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BGNP21810 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BGNP21810 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BGNP21810 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BGNP21810 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BGNP21810 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BGNP21810 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BGNP21810 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BGNP21810 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BGNP21810 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BGNP21810 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BGNP21810 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BGNP21810 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BGNP21810 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BGNP21810 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BGNP21810 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BGNP21810 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BGNP21810 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BGNP21810 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BGNP21810 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BGNP21810 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BGNP21810 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BGNP21810 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BGNP21810 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BGNP21810 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BGNP21810 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BGNP21810 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BGNP21810 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BGNP21810 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BGNP21810 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BGNP21810 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BGNP21810 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BGNP21810 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BGNP21810 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BGNP21810 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BGNP21810 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BGNP21810 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BGNP21810 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BGNP21810 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BGNP21810 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BGNP21810 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BGNP21810 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BGNP21810 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BGNP21810 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BGNP21810 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BGNP21810 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BGNP21810 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BGNP21810 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BGNP21810 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BGNP21810 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BGNP21810 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BGNP21810 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BGNP21810 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BGNP21810 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BGNP21810 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BGNP21810 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BGNP21810 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BGNP21810 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BGNP21810 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BGNP21810 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BGNP21810 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BGNP21810 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BGNP21810 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BGNP21810 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BGNP21810 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BGNP21810 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BGNP21810 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BGNP21810 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BGNP21810 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BGNP21810 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BGNP21810 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BGNP21810 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BGNP21810 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BGNP21810 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BGNP21810 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BGNP21810 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BGNP21810 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms