Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMNB1P20700 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB1P20700 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms