Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3BP20337 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms