Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNI1P19237 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms