Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XRCC1P18887 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms