Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAM1P18669 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM1P18669 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms