Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB2P17787 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms