Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DESP17661 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DESP17661 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DESP17661 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DESP17661 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DESP17661 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DESP17661 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DESP17661 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DESP17661 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESP17661 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESP17661 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESP17661 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESP17661 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESP17661 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESP17661 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESP17661 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESP17661 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESP17661 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DESP17661 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DESP17661 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DESP17661 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DESP17661 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DESP17661 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DESP17661 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DESP17661 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DESP17661 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DESP17661 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DESP17661 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DESP17661 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DESP17661 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DESP17661 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DESP17661 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DESP17661 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DESP17661 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DESP17661 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DESP17661 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DESP17661 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DESP17661 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DESP17661 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESP17661 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESP17661 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESP17661 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESP17661 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESP17661 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESP17661 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DESP17661 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESP17661 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESP17661 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESP17661 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DESP17661 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DESP17661 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DESP17661 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DESP17661 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DESP17661 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DESP17661 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DESP17661 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DESP17661 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DESP17661 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DESP17661 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DESP17661 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DESP17661 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DESP17661 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DESP17661 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DESP17661 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DESP17661 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DESP17661 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DESP17661 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DESP17661 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DESP17661 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DESP17661 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms