Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB42P16452 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB42P16452 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB42P16452 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB42P16452 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB42P16452 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB42P16452 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB42P16452 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EPB42P16452 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPB42P16452 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB42P16452 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB42P16452 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB42P16452 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB42P16452 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB42P16452 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB42P16452 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB42P16452 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB42P16452 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB42P16452 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPB42P16452 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPB42P16452 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB42P16452 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB42P16452 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB42P16452 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB42P16452 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB42P16452 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB42P16452 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB42P16452 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB42P16452 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB42P16452 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB42P16452 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB42P16452 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB42P16452 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB42P16452 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB42P16452 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB42P16452 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB42P16452 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB42P16452 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB42P16452 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB42P16452 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB42P16452 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB42P16452 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB42P16452 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB42P16452 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB42P16452 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB42P16452 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB42P16452 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB42P16452 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB42P16452 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB42P16452 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB42P16452 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB42P16452 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB42P16452 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB42P16452 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB42P16452 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB42P16452 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB42P16452 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB42P16452 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB42P16452 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB42P16452 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB42P16452 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB42P16452 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB42P16452 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB42P16452 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB42P16452 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB42P16452 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB42P16452 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB42P16452 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB42P16452 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB42P16452 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB42P16452 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms