Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GATA1P15976 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GATA1P15976 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATA1P15976 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATA1P15976 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATA1P15976 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATA1P15976 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATA1P15976 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATA1P15976 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATA1P15976 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATA1P15976 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GATA1P15976 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATA1P15976 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATA1P15976 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATA1P15976 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATA1P15976 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATA1P15976 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATA1P15976 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATA1P15976 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GATA1P15976 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GATA1P15976 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GATA1P15976 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATA1P15976 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATA1P15976 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATA1P15976 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATA1P15976 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATA1P15976 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GATA1P15976 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GATA1P15976 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATA1P15976 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATA1P15976 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GATA1P15976 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GATA1P15976 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GATA1P15976 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GATA1P15976 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATA1P15976 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATA1P15976 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATA1P15976 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATA1P15976 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GATA1P15976 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GATA1P15976 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATA1P15976 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GATA1P15976 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GATA1P15976 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms