Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPA1P15085 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPA1P15085 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CPA1P15085 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA1P15085 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA1P15085 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA1P15085 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA1P15085 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA1P15085 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CPA1P15085 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA1P15085 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA1P15085 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA1P15085 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA1P15085 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA1P15085 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA1P15085 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPA1P15085 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPA1P15085 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPA1P15085 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPA1P15085 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPA1P15085 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPA1P15085 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPA1P15085 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPA1P15085 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPA1P15085 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPA1P15085 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPA1P15085 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPA1P15085 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPA1P15085 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPA1P15085 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA1P15085 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA1P15085 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA1P15085 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA1P15085 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA1P15085 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPA1P15085 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA1P15085 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA1P15085 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA1P15085 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA1P15085 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA1P15085 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA1P15085 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA1P15085 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPA1P15085 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPA1P15085 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPA1P15085 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPA1P15085 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPA1P15085 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA1P15085 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA1P15085 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA1P15085 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA1P15085 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA1P15085 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA1P15085 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA1P15085 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA1P15085 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA1P15085 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPA1P15085 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPA1P15085 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CPA1P15085 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPA1P15085 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPA1P15085 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPA1P15085 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPA1P15085 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPA1P15085 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPA1P15085 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPA1P15085 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA1P15085 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA1P15085 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA1P15085 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA1P15085 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA1P15085 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA1P15085 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPA1P15085 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA1P15085 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA1P15085 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA1P15085 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA1P15085 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA1P15085 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA1P15085 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA1P15085 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA1P15085 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA1P15085 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA1P15085 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA1P15085 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA1P15085 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA1P15085 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms