Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB2P14652 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB2P14652 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB2P14652 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms