Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC130P13994 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC130P13994 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms