Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms