Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GP1BBP13224 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GP1BBP13224 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms