Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFHP12036 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFHP12036 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFHP12036 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFHP12036 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFHP12036 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFHP12036 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFHP12036 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFHP12036 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFHP12036 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFHP12036 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFHP12036 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFHP12036 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFHP12036 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFHP12036 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFHP12036 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFHP12036 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFHP12036 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFHP12036 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFHP12036 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFHP12036 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFHP12036 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFHP12036 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFHP12036 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFHP12036 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFHP12036 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFHP12036 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFHP12036 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFHP12036 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFHP12036 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFHP12036 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFHP12036 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFHP12036 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFHP12036 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEFHP12036 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFHP12036 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFHP12036 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFHP12036 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFHP12036 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFHP12036 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFHP12036 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFHP12036 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFHP12036 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFHP12036 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEFHP12036 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NEFHP12036 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFHP12036 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFHP12036 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFHP12036 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEFHP12036 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEFHP12036 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFHP12036 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFHP12036 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFHP12036 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFHP12036 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFHP12036 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFHP12036 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFHP12036 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFHP12036 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFHP12036 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFHP12036 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEFHP12036 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFHP12036 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFHP12036 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFHP12036 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFHP12036 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFHP12036 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFHP12036 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFHP12036 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFHP12036 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFHP12036 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFHP12036 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFHP12036 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFHP12036 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFHP12036 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFHP12036 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFHP12036 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFHP12036 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFHP12036 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFHP12036 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFHP12036 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFHP12036 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFHP12036 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFHP12036 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFHP12036 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFHP12036 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFHP12036 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFHP12036 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms