Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK4P11802 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK4P11802 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK4P11802 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK4P11802 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK4P11802 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK4P11802 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK4P11802 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK4P11802 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK4P11802 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK4P11802 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK4P11802 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK4P11802 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK4P11802 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK4P11802 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK4P11802 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK4P11802 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK4P11802 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK4P11802 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK4P11802 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK4P11802 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK4P11802 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK4P11802 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK4P11802 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK4P11802 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK4P11802 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK4P11802 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK4P11802 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK4P11802 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK4P11802 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK4P11802 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK4P11802 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK4P11802 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK4P11802 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK4P11802 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK4P11802 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK4P11802 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK4P11802 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK4P11802 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK4P11802 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK4P11802 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK4P11802 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK4P11802 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK4P11802 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK4P11802 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK4P11802 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK4P11802 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK4P11802 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK4P11802 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK4P11802 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK4P11802 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK4P11802 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK4P11802 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK4P11802 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK4P11802 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK4P11802 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK4P11802 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK4P11802 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK4P11802 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK4P11802 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK4P11802 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK4P11802 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK4P11802 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK4P11802 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK4P11802 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK4P11802 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK4P11802 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK4P11802 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK4P11802 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK4P11802 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK4P11802 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK4P11802 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK4P11802 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK4P11802 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK4P11802 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK4P11802 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK4P11802 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK4P11802 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK4P11802 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms