Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNB1P11230 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB1P11230 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms