Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRAP10827 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRAP10827 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THRAP10827 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THRAP10827 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THRAP10827 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THRAP10827 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
THRAP10827 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRAP10827 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRAP10827 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRAP10827 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRAP10827 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRAP10827 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRAP10827 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRAP10827 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRAP10827 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THRAP10827 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP10827 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP10827 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP10827 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP10827 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP10827 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP10827 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP10827 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP10827 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP10827 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP10827 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THRAP10827 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP10827 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP10827 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP10827 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP10827 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP10827 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP10827 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP10827 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP10827 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP10827 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP10827 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
THRAP10827 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
THRAP10827 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
THRAP10827 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
THRAP10827 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP10827 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP10827 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP10827 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP10827 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP10827 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP10827 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP10827 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP10827 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP10827 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP10827 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms