Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL3P10147 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL3P10147 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL3P10147 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3P10147 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3P10147 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3P10147 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3P10147 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL3P10147 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCL3P10147 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCL3P10147 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCL3P10147 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL3P10147 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL3P10147 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL3P10147 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL3P10147 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL3P10147 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL3P10147 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL3P10147 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3P10147 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3P10147 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3P10147 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3P10147 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3P10147 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3P10147 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3P10147 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3P10147 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3P10147 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3P10147 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL3P10147 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL3P10147 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL3P10147 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL3P10147 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL3P10147 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL3P10147 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL3P10147 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL3P10147 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL3P10147 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3P10147 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3P10147 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3P10147 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3P10147 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3P10147 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3P10147 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3P10147 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL3P10147 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL3P10147 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL3P10147 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL3P10147 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL3P10147 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL3P10147 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL3P10147 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL3P10147 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL3P10147 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL3P10147 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL3P10147 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL3P10147 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL3P10147 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL3P10147 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL3P10147 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL3P10147 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL3P10147 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL3P10147 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL3P10147 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL3P10147 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL3P10147 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms