Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM225BP0DP42 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms