Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CALM1P0DP23 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALM1P0DP23 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CALM1P0DP23 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALM1P0DP23 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALM1P0DP23 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALM1P0DP23 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALM1P0DP23 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALM1P0DP23 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALM1P0DP23 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALM1P0DP23 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALM1P0DP23 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALM1P0DP23 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALM1P0DP23 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms