Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC166P0CW27 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms