Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC175P0C221 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC175P0C221 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC175P0C221 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms