Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT19P08727 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT19P08727 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT19P08727 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT19P08727 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT19P08727 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT19P08727 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT19P08727 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT19P08727 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT19P08727 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT19P08727 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT19P08727 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT19P08727 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT19P08727 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT19P08727 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT19P08727 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT19P08727 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT19P08727 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT19P08727 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT19P08727 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT19P08727 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT19P08727 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT19P08727 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT19P08727 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT19P08727 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT19P08727 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT19P08727 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT19P08727 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT19P08727 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT19P08727 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT19P08727 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT19P08727 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT19P08727 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT19P08727 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT19P08727 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT19P08727 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT19P08727 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT19P08727 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT19P08727 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT19P08727 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT19P08727 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT19P08727 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT19P08727 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT19P08727 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT19P08727 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT19P08727 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT19P08727 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT19P08727 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT19P08727 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT19P08727 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT19P08727 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT19P08727 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT19P08727 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT19P08727 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT19P08727 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT19P08727 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT19P08727 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT19P08727 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT19P08727 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT19P08727 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT19P08727 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT19P08727 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT19P08727 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT19P08727 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT19P08727 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT19P08727 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT19P08727 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms