Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBBP07437 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBBP07437 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBBP07437 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBBP07437 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBBP07437 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBBP07437 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBBP07437 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBBP07437 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBBP07437 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBBP07437 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBBP07437 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBBP07437 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBBP07437 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBBP07437 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBBP07437 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBBP07437 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBBP07437 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBBP07437 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBBP07437 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBBP07437 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBBP07437 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBBP07437 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBBP07437 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBBP07437 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBBP07437 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBBP07437 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBBP07437 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBBP07437 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBBP07437 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBBP07437 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBBP07437 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBBP07437 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBBP07437 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBBP07437 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBBP07437 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBBP07437 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBBP07437 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBBP07437 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBBP07437 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBBP07437 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBBP07437 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBBP07437 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBBP07437 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBBP07437 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBBP07437 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBBP07437 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBBP07437 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBBP07437 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBBP07437 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBBP07437 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBBP07437 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBBP07437 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBBP07437 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBBP07437 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBBP07437 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBBP07437 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBBP07437 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBBP07437 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBBP07437 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBBP07437 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBBP07437 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBBP07437 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBBP07437 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBBP07437 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBBP07437 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBBP07437 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBBP07437 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBBP07437 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms