Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMG1P04279 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMG1P04279 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMG1P04279 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMG1P04279 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMG1P04279 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMG1P04279 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMG1P04279 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMG1P04279 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMG1P04279 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMG1P04279 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMG1P04279 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMG1P04279 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMG1P04279 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMG1P04279 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMG1P04279 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMG1P04279 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMG1P04279 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMG1P04279 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMG1P04279 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMG1P04279 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMG1P04279 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMG1P04279 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMG1P04279 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMG1P04279 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMG1P04279 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMG1P04279 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMG1P04279 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMG1P04279 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMG1P04279 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMG1P04279 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms