Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGKV1-17P01599 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGKV1-17P01599 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms