Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ASS1P00966 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASS1P00966 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASS1P00966 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ASS1P00966 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASS1P00966 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASS1P00966 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASS1P00966 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASS1P00966 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASS1P00966 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASS1P00966 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASS1P00966 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASS1P00966 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASS1P00966 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASS1P00966 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASS1P00966 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASS1P00966 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASS1P00966 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASS1P00966 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASS1P00966 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASS1P00966 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASS1P00966 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASS1P00966 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASS1P00966 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASS1P00966 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASS1P00966 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASS1P00966 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASS1P00966 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASS1P00966 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASS1P00966 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASS1P00966 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASS1P00966 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASS1P00966 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASS1P00966 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASS1P00966 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ASS1P00966 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASS1P00966 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASS1P00966 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ASS1P00966 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASS1P00966 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASS1P00966 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASS1P00966 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASS1P00966 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASS1P00966 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASS1P00966 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASS1P00966 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASS1P00966 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASS1P00966 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASS1P00966 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASS1P00966 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASS1P00966 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ASS1P00966 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASS1P00966 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASS1P00966 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASS1P00966 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASS1P00966 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASS1P00966 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ASS1P00966 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASS1P00966 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASS1P00966 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASS1P00966 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASS1P00966 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASS1P00966 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASS1P00966 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASS1P00966 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASS1P00966 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASS1P00966 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASS1P00966 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASS1P00966 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASS1P00966 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASS1P00966 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ASS1P00966 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ASS1P00966 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASS1P00966 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASS1P00966 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ASS1P00966 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASS1P00966 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ASS1P00966 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ASS1P00966 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASS1P00966 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASS1P00966 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASS1P00966 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASS1P00966 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ASS1P00966 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms