Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
APBA3O96018 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APBA3O96018 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APBA3O96018 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APBA3O96018 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
APBA3O96018 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
APBA3O96018 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
APBA3O96018 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
APBA3O96018 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
APBA3O96018 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APBA3O96018 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
APBA3O96018 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APBA3O96018 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APBA3O96018 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APBA3O96018 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APBA3O96018 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APBA3O96018 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APBA3O96018 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APBA3O96018 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
APBA3O96018 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APBA3O96018 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APBA3O96018 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APBA3O96018 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APBA3O96018 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APBA3O96018 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APBA3O96018 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
APBA3O96018 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
APBA3O96018 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APBA3O96018 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
APBA3O96018 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APBA3O96018 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APBA3O96018 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
APBA3O96018 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
APBA3O96018 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APBA3O96018 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APBA3O96018 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APBA3O96018 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APBA3O96018 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APBA3O96018 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APBA3O96018 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APBA3O96018 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APBA3O96018 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APBA3O96018 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APBA3O96018 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APBA3O96018 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APBA3O96018 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APBA3O96018 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APBA3O96018 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APBA3O96018 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
APBA3O96018 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
APBA3O96018 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
APBA3O96018 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
APBA3O96018 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
APBA3O96018 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APBA3O96018 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APBA3O96018 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APBA3O96018 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APBA3O96018 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APBA3O96018 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APBA3O96018 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APBA3O96018 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APBA3O96018 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APBA3O96018 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APBA3O96018 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APBA3O96018 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APBA3O96018 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APBA3O96018 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APBA3O96018 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APBA3O96018 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APBA3O96018 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APBA3O96018 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APBA3O96018 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APBA3O96018 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APBA3O96018 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APBA3O96018 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APBA3O96018 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APBA3O96018 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APBA3O96018 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APBA3O96018 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APBA3O96018 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APBA3O96018 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APBA3O96018 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APBA3O96018 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APBA3O96018 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APBA3O96018 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APBA3O96018 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
APBA3O96018 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
APBA3O96018 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APBA3O96018 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APBA3O96018 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APBA3O96018 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APBA3O96018 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APBA3O96018 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APBA3O96018 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APBA3O96018 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APBA3O96018 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APBA3O96018 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APBA3O96018 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APBA3O96018 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APBA3O96018 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms