Protein–RNA interactions for Protein: O95727

CRTAM, Cytotoxic and regulatory T-cell molecule, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAMO95727 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAMO95727 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRTAMO95727 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRTAMO95727 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms