Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD1O95696 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD1O95696 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD1O95696 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD1O95696 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD1O95696 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD1O95696 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRD1O95696 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRD1O95696 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRD1O95696 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRD1O95696 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRD1O95696 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRD1O95696 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRD1O95696 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRD1O95696 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BRD1O95696 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRD1O95696 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRD1O95696 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD1O95696 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD1O95696 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD1O95696 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD1O95696 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD1O95696 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD1O95696 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRD1O95696 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRD1O95696 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRD1O95696 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRD1O95696 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD1O95696 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD1O95696 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD1O95696 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRD1O95696 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD1O95696 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD1O95696 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD1O95696 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD1O95696 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD1O95696 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD1O95696 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRD1O95696 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRD1O95696 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRD1O95696 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRD1O95696 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRD1O95696 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRD1O95696 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD1O95696 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD1O95696 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD1O95696 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD1O95696 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD1O95696 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD1O95696 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD1O95696 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRD1O95696 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD1O95696 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD1O95696 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD1O95696 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD1O95696 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD1O95696 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD1O95696 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD1O95696 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD1O95696 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRD1O95696 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD1O95696 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD1O95696 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD1O95696 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD1O95696 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD1O95696 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD1O95696 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD1O95696 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRD1O95696 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRD1O95696 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD1O95696 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD1O95696 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD1O95696 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD1O95696 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD1O95696 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD1O95696 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD1O95696 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD1O95696 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRD1O95696 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD1O95696 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD1O95696 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD1O95696 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD1O95696 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD1O95696 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD1O95696 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD1O95696 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD1O95696 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD1O95696 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD1O95696 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms