Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNTO95613 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNTO95613 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNTO95613 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNTO95613 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNTO95613 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNTO95613 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCNTO95613 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PCNTO95613 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCNTO95613 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PCNTO95613 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCNTO95613 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCNTO95613 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCNTO95613 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCNTO95613 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCNTO95613 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCNTO95613 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PCNTO95613 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PCNTO95613 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCNTO95613 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCNTO95613 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCNTO95613 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCNTO95613 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNTO95613 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNTO95613 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNTO95613 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCNTO95613 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNTO95613 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNTO95613 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNTO95613 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNTO95613 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNTO95613 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNTO95613 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNTO95613 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNTO95613 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNTO95613 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNTO95613 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNTO95613 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNTO95613 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNTO95613 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNTO95613 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNTO95613 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNTO95613 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNTO95613 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNTO95613 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNTO95613 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNTO95613 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNTO95613 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNTO95613 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNTO95613 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNTO95613 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNTO95613 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNTO95613 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNTO95613 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNTO95613 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNTO95613 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNTO95613 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNTO95613 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNTO95613 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNTO95613 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNTO95613 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNTO95613 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCNTO95613 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNTO95613 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNTO95613 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNTO95613 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNTO95613 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNTO95613 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNTO95613 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNTO95613 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNTO95613 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNTO95613 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNTO95613 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCNTO95613 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCNTO95613 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCNTO95613 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCNTO95613 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCNTO95613 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PCNTO95613 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNTO95613 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNTO95613 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNTO95613 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNTO95613 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNTO95613 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNTO95613 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNTO95613 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNTO95613 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCNTO95613 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCNTO95613 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCNTO95613 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCNTO95613 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCNTO95613 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCNTO95613 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCNTO95613 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCNTO95613 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCNTO95613 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCNTO95613 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCNTO95613 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCNTO95613 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCNTO95613 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms