Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1O95476 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTDNEP1O95476 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CTDNEP1O95476 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms