Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LETM1O95202 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LETM1O95202 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LETM1O95202 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LETM1O95202 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LETM1O95202 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LETM1O95202 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LETM1O95202 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LETM1O95202 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LETM1O95202 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LETM1O95202 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LETM1O95202 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LETM1O95202 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LETM1O95202 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LETM1O95202 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LETM1O95202 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LETM1O95202 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LETM1O95202 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LETM1O95202 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LETM1O95202 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LETM1O95202 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LETM1O95202 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LETM1O95202 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LETM1O95202 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LETM1O95202 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LETM1O95202 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LETM1O95202 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LETM1O95202 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LETM1O95202 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LETM1O95202 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LETM1O95202 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LETM1O95202 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LETM1O95202 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LETM1O95202 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LETM1O95202 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LETM1O95202 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LETM1O95202 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LETM1O95202 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LETM1O95202 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LETM1O95202 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LETM1O95202 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LETM1O95202 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LETM1O95202 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LETM1O95202 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LETM1O95202 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LETM1O95202 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LETM1O95202 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LETM1O95202 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LETM1O95202 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LETM1O95202 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LETM1O95202 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LETM1O95202 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LETM1O95202 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LETM1O95202 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LETM1O95202 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LETM1O95202 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LETM1O95202 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LETM1O95202 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LETM1O95202 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LETM1O95202 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LETM1O95202 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LETM1O95202 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LETM1O95202 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LETM1O95202 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LETM1O95202 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LETM1O95202 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LETM1O95202 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LETM1O95202 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LETM1O95202 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LETM1O95202 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LETM1O95202 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LETM1O95202 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LETM1O95202 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LETM1O95202 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LETM1O95202 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LETM1O95202 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LETM1O95202 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LETM1O95202 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LETM1O95202 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LETM1O95202 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LETM1O95202 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM1O95202 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM1O95202 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM1O95202 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM1O95202 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM1O95202 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM1O95202 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM1O95202 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM1O95202 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM1O95202 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM1O95202 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM1O95202 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms