Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG12O94817 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG12O94817 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG12O94817 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG12O94817 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG12O94817 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG12O94817 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG12O94817 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG12O94817 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG12O94817 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG12O94817 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG12O94817 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG12O94817 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG12O94817 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG12O94817 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG12O94817 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG12O94817 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG12O94817 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG12O94817 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG12O94817 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG12O94817 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG12O94817 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG12O94817 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG12O94817 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG12O94817 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG12O94817 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG12O94817 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG12O94817 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG12O94817 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG12O94817 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG12O94817 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG12O94817 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG12O94817 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG12O94817 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG12O94817 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG12O94817 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG12O94817 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG12O94817 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG12O94817 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG12O94817 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG12O94817 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG12O94817 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG12O94817 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG12O94817 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG12O94817 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG12O94817 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG12O94817 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG12O94817 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms